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擬南芥（Arabidopsis thaliana）是十字花科擬南芥屬植物，雖然沒有經濟價值，但具有生育周期短，植株個體小及基因組小等特點，因而長期以來一直被用來作為分子生物學和傳統遺傳學研究的模式實驗材料，作為高等植物中具有最少基因組的物種，在科學研究中的地位也是極為重要的。
可見光表型參數提取
通過Lemna Tec表型軟件分析，可以得到緊密性、旋轉對稱性、偏心率、表面覆蓋率、中度葉寬指數、面積/周長等參數，進行表型分析。
緊密性（Compactness）
緊湊性根據植株旋轉動量計算，不考慮植株大小，上圖顯示了緊湊性與葉面積的比較。緊湊性可以描述為葉片到形心距離的遠近，比如葉柄的長度是其中一個參數。
旋轉對稱性（Rotational Symmetry）
完整植株的旋轉對稱可根據不依賴于大小的二階矩主軸的比例計算。這個參數整合植株的全部形態而且與大小無關。旋轉對稱可描述為葉片在多大程度上反映一個對稱植株的的整體表現。
偏心率（Excentricity）
表面覆蓋率（Surface Coverage）
表面覆蓋率是植株面積與可覆蓋植株的圓面積的比值。此參數是為了提供一個值以顯示植物覆蓋在其生長區域的土壤上的密集程度。
面積/周長（Area/Circumference）
葉面積除以周長的比率可以允許對更多的形態性狀進行分類。
兩組植物區分應用（Application to Separate Two Groups）
下面這個實例的目的是把兩組植株區別開。這個方法用粗壯和緊湊性做為分離因子很好地區分了兩組植株。
近紅外鏡頭成像表型數據分析
下圖c為一株擬南芥植株冠層相對含水量分布圖。
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