AgriphenoTM高通量基因分型檢測平臺
AgriphenoTM高通量基因分型檢測平臺包括高通量Oktopure DNA提取儀、Nexar?模塊化內聯液處理與分析系統、Soellex?高通量PCR水浴熱循環系統和Araya?內聯熒光檢測系統。
Oktopure DNA提取儀采用磁珠的方法提取DNA,通量達到800個樣本/3小時。同時,適用于多種樣本類型的DNA提取,包括植物葉片、種子,毛發、血方卡、精液、口拭子、唾液、組織等。提取的DNA適用于多種下游應用,如基因分型、一代測序、二代測序等。
Nexar高通量吸取樣品DNA和引物、mix至384孔卷帶并封膜。Soellex對封膜完成的卷帶進行PCR水浴熱循環,每次最多可達230,000個樣本。Araya對水浴完成的卷帶掃描分析,28秒掃描一張卷帶。
AgriphenoTM基因分型采用KASP(Kompetitive Allele Specific PCR)原理,對目標SNPs和InDels進行精準的雙等位基因分型。反應體系僅1.6μl,具有高通量、低成本,準確率和檢出率接近100%的明顯優勢。
| 客戶須提供 每個位點至少10個陽性對照。 服務周期 引物測試完成后,每批樣品一周內出結果。 服務特點 高通量、低成本、快速準確。 |
應用案例
-牛毛基因分型
項目背景:牛奶里的蛋白有兩種,酪蛋白和乳清蛋白。酪蛋白中的β酪蛋白分為A1和A2型。人在消化蛋白的時候,消化酶會在A1β酪蛋白67號位置一刀切,產生一種7個氨基酸的肽鏈(BCM-7),而無法切A2蛋白。BCM-7會導致許多人無法吸收牛奶中的營養成分,通常表現為喝奶后出現不同程度的脹氣、腹痛、腹瀉等胃腸不適現象。而A2型牛奶更易吸收。
A1, A2的區別是由奶牛的基因不同造成的,不同基因的奶牛會生產出含有不同蛋白質類型的牛奶。所以,需要檢測奶牛的基因型用于奶牛育種。
項目目的:檢測不同奶牛的SNP基因型(決定牛奶A1A2類型的位點)。
實驗過程 | 分型結果 |
每個數據點代表一個獨立的DNA樣本的熒光信號,相同基因型的樣本會發出相似水平的熒光,因此富集在一起。