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基于深度學(xué)習(xí)的計(jì)算機(jī)視覺在農(nóng)業(yè)植物表型分析中的應(yīng)用

文章來源: | 2021-01-04

隨著世界糧食需求的不斷增長(zhǎng),農(nóng)業(yè)面臨越來越大的挑戰(zhàn),有效的作物管理技術(shù)是提高作物產(chǎn)量的必要手段。精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)是一套監(jiān)測(cè)作物、收集數(shù)據(jù)并執(zhí)行作物管理任務(wù)(如施用最佳水量、選擇合適殺蟲劑),減少環(huán)境影響的方法。準(zhǔn)確的作物監(jiān)測(cè)在很大程度上有助于幫助農(nóng)民做出正確的選擇,以獲得最高產(chǎn)量。植物表型是植物遺傳在特定環(huán)境下表達(dá)出來的植物特性,包括結(jié)構(gòu)、生化、能量傳遞過程等。植物表型組學(xué)可以認(rèn)為是研究植物表型特征的科學(xué),涵蓋器官、植株、冠層功能等多種尺度。植物表型分析為植物的特性及其在各種環(huán)境條件下的行為提供了定量的評(píng)估。了解這些特性對(duì)于進(jìn)行有效的作物管理至關(guān)重要。

 

由于RGB、多光譜和高光譜相機(jī)等具有成本效益且易于使用的數(shù)字成像設(shè)備的可用性,植物表型的研究迅速發(fā)展,這些設(shè)備促進(jìn)了大量數(shù)據(jù)的收集。大量數(shù)據(jù)的涌入加上機(jī)器學(xué)習(xí)算法的使用,推動(dòng)了各種高通量表型工具的發(fā)展,這些工具用于雜草檢測(cè)、果實(shí)/器官計(jì)數(shù)、疾病檢測(cè)和產(chǎn)量估計(jì)等任務(wù)。但眾所周知,機(jī)器學(xué)習(xí)缺乏穩(wěn)健性,嚴(yán)重依賴手工特征提取技術(shù)和人工超參數(shù)優(yōu)化方法。因此,從數(shù)據(jù)中提取特征一直是發(fā)展高效、高通量植物表型系統(tǒng)的主要瓶頸之一。

 

深度學(xué)習(xí)是機(jī)器學(xué)習(xí)的一個(gè)子領(lǐng)域,它允許對(duì)大規(guī)模數(shù)據(jù)進(jìn)行自動(dòng)特征提取和預(yù)測(cè),它的進(jìn)步促進(jìn)了植物表型分析方法的迅猛發(fā)展。深度學(xué)習(xí)以其在處理基于視覺的任務(wù)(如圖像分類、目標(biāo)檢測(cè)、語義分割和場(chǎng)景理解)方面的有效性而聞名。圖1說明了基于機(jī)器學(xué)習(xí)和基于深度學(xué)習(xí)的植物表型分析之間的差異。我們相信,植物研究人員可以有效地利用深度學(xué)習(xí)的表現(xiàn)力和穩(wěn)健性,從原始數(shù)據(jù)中識(shí)別復(fù)雜的模式,并設(shè)計(jì)高效的精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)方法。

 

本文旨在介紹基于深度學(xué)習(xí)的植物表型研究領(lǐng)域的進(jìn)展以及有待進(jìn)一步研究的問題。

 

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圖1 基于機(jī)器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)的植物表型分析的差異
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圖2 人工智能的分類
AI:ArtificialIntelligence, 人工智能;ML:Machine Learning, 機(jī)器學(xué)習(xí);NN:Neural Networks, 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò);DL:Deep Learning, 深度學(xué)習(xí);SNN:Spiking Neural Networks, 脈沖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。
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圖3 一種卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) ( CNN ) 的結(jié)構(gòu)(由卷積層、池化層和全連接層組成)
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圖4 全連接層和卷積層之間的差異
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圖5 圖像分類、目標(biāo)檢測(cè)和圖像分割之間差異的直觀說明
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圖6 來自CropDeep數(shù)據(jù)集的一些注釋示例
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圖7 基于弱監(jiān)督的主動(dòng)學(xué)習(xí)方法框架

由于相關(guān)研究?jī)?nèi)容非常專業(yè),難免有些理解不準(zhǔn)確或者編輯整理的疏漏,請(qǐng)以英文原文為準(zhǔn)。
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Chandra A L, Desai S V, Guo W, et al. Computervision with deep learning for plant phenotyping in agriculture: A survey. arXiv preprint arXiv:2006.11391, 2020.

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