使用AgriPheno?平臺的實驗室版的高通量表型測量系統Scanalyzer HTS 近紅外及可見光鏡頭進行成像。利用近紅外下種子照片對應的灰度值不同反應相對含水量的分布情況。利用可見光成像，對種子形態以及種子凈度等相關參數測定。通過出芽后種子的形態、大小以及顏色等表型的不同來分析種子的發芽率等相關參數。
| 1， 種子含水量分布（相對值）由近紅外成像，分析軟件對灰度值進行分析。灰度值高，含水量高；灰度值低。含水量低。 | |
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2，利用Lemna HTS得到單粒種子大小，可用來比較不同種子間的大小差異及正態分布關系。 | |
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| 3，HTS頂部可見光成像后，利用分析軟件基于種子形態、大小篩選進行篩選。 | |
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4，基于種子出芽后形態與出芽前形態變化進行篩選。利用緊密度（與面積及長寬有關）、邊界點圓度（出芽后該值會發生變化）。 | |
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5，基于種子出芽后芽的顏色與種子顏色不同進行篩選。 | |
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利用AgriPheno?平臺的實驗室版的高通量表型測量系統Scanalyzer HTS結合種子常用的一些處理方式，能夠實現對單粒種子表型特征的高通量精準測量；同時可以無損測量的同時獲得其他測量方法無法獲得的參數，比如種子含水量。
